Компания «Аэроэкспресс» принимает активное участие в улучшении социальных условий жизни населения и защите окружающей среды в Москве, решая важную социальную задачу по формированию современной транспортной инфраструктуры мегаполиса, разгрузки основных автомагистралей и улучшению экологической обстановки. Являясь клиентоориентированной компанией, она постоянно расширяет спектр услуг, внедряет инновации, формирует стандарты обслуживания в соответствии с лучшими мировыми аналогами.
Деятельность «Аэроэкспресс» учитывает интересы социально незащищённых слоёв населения. Помимо специальных мест в вагонах для инвалидов-колясочников и туалетных комплексов в вагонах и терминалах компании, все кассы компании оборудованы специальными переговорными устройствами с регулируемым уровнем громкости для людей с пониженным слухом. Предоставляется услуга «Персональный помощник» по сопровождению инвалидов-колясочников при проезде на аэроэкспрессе. Платформы вокзалов и терминалов оборудованы тактильной плиткой, позволяющей незрячим пассажирам передвигаться самостоятельно. В декабре 2013 года компания запустила версию сайта для слабовидящих пассажиров.
«Аэроэкспресс» является социально ориентированной компанией и оказывает многолетнюю поддержку Благотворительному Фонду «Расправь крылья!». С 2009 года компания «Аэроэкспресс» является постоянным партнером всероссийской благотворительной акции «Поезд надежды», проводимой в рамках социального проекта «Детский вопрос» ГРК «Радио России» совместно с Благотворительным Фондом «Расправь крылья!» и ОАО «Аэрофлот - российские авиалинии». «Поезд надежды» — это организация встречи потенциальных усыновителей и опекунов с детьми, оставшимися без родительского попечения.
В 2013 году компания «Аэроэкспресс» взяла шефство над специальной (коррекционной) общеобразовательной школой-интернатом города Дедовск и делает все возможное для помощи своим подопечным в социальной адаптации. В июне 2013 года компания «Аэроэкспресс», в сотрудничестве с аэропортом «Шереметьево», провела «день открытых дверей» для воспитанников школы-интерната. Ребята приняли участие в обзорной экскурсии по объектам компании «Аэроэкспресс» и аэропорта «Шереметьево».